MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 6173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017040	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017040	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017040	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017040	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017040	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017040	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017040	TC	3	6	1656	1661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017040	TA	3	6	1682	1687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017040	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017040	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017040	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017040	T	7	7	2904	2910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017040	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017040	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017040	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017040	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017040	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017040	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017040	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017040	TCT	2	6	3426	3431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017040	T	6	6	3433	3438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017040	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017040	TTGA	2	8	3451	3458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017040	GAA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017040	AAC	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017040	GAAC	2	8	8785	8792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017040	TGC	2	6	8829	8834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017040	A	6	6	8860	8865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017040	A	6	6	14789	14794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017040	T	6	6	14820	14825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017040	GAT	2	6	14890	14895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017040	T	7	7	14900	14906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017040	TTA	2	6	14909	14914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017040	A	6	6	14970	14975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017040	AAT	2	6	14995	15000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017040	AGA	2	6	15001	15006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017040	AGA	2	6	15009	15014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017040	ACTA	2	8	15060	15067	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017040	TAG	2	6	15077	15082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017040	ATA	2	6	16510	16515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017040	ACATT	2	10	16523	16532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017040	AGT	2	6	16560	16565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017040	TACT	2	8	16578	16585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017040	AT	3	6	16691	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017040	A	6	6	16710	16715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017040	A	7	7	16793	16799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017040	TAA	2	6	16832	16837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017040	AAAT	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017040	AG	3	6	17072	17077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017040	GGC	2	6	17104	17109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017040	ACCT	2	8	17195	17202	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017040	CGA	2	6	17349	17354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017040	GCA	2	6	17423	17428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017040	CGC	2	6	17470	17475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017040	GTGA	2	8	17476	17483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017040	TGT	2	6	17509	17514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017040	AGA	2	6	17518	17523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017040	ATG	2	6	17524	17529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017040	CCA	2	6	17545	17550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017040	TAAC	2	8	17559	17566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017040	CAG	2	6	17592	17597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017040	AGCG	2	8	17647	17654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017040	T	6	6	17662	17667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017040	AT	3	6	17776	17781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017040	GGA	2	6	17782	17787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017040	CT	3	6	17807	17812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017040	GAA	2	6	18046	18051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017040	GGT	2	6	18120	18125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017040	GTC	2	6	18134	18139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017040	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017040	CAT	2	6	18202	18207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017040	TAA	2	6	18237	18242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017040	GGA	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017040	ATC	2	6	18270	18275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017040	AC	3	6	18297	18302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017040	TGGT	2	8	18312	18319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017040	CGC	2	6	18436	18441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017040	AC	3	6	18466	18471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017040	CAC	2	6	18481	18486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017040	AGCC	2	8	18529	18536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017040	GAT	2	6	18552	18557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017040	CCT	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017040	AGG	2	6	18707	18712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017040	CTA	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017040	TG	3	6	18821	18826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017040	AGCG	2	8	18875	18882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017040	TA	3	6	18896	18901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017040	TAA	2	6	19001	19006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017040	A	6	6	19019	19024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017040	TAA	2	6	19031	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017040	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017040	GAA	2	6	19084	19089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017040	ACG	2	6	19101	19106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017040	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017040	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017040	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017040	TAG	2	6	19272	19277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017040	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017040	AGA	2	6	19360	19365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017040	AG	3	6	19388	19393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017040	GGA	2	6	19476	19481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017040	CT	3	6	19502	19507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017040	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017040	ACA	2	6	19594	19599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017040	ATG	2	6	19661	19666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017040	TGT	2	6	19731	19736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017040	GGA	2	6	19794	19799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017040	TC	3	6	19880	19885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017040	ATC	2	6	20001	20006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017040	ACC	2	6	20059	20064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017040	AGC	2	6	20139	20144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017040	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017040	TG	3	6	20270	20275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017040	AAG	2	6	20276	20281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017040	GAG	2	6	20291	20296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017040	GA	3	6	20421	20426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017040	TA	3	6	20475	20480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017040	AGG	2	6	20485	20490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017040	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017040	TAG	2	6	20604	20609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017040	GA	3	6	20717	20722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017040	CT	3	6	20832	20837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017040	GAT	2	6	20850	20855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017040	AGG	2	6	20895	20900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017040	CGG	2	6	20941	20946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017040	GA	3	6	21039	21044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017040	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017040	GTT	2	6	21201	21206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017040	TAC	2	6	21211	21216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017040	CCT	2	6	21299	21304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017040	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017040	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017040	GGT	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017040	TCG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017040	CGT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017040	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017040	C	6	6	21806	21811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_017040	GA	3	6	21854	21859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017040	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017040	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_017040	CAG	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017040	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017040	AC	3	6	22147	22152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017040	AGT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017040	T	6	6	22338	22343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017040	CGT	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017040	GAG	2	6	22682	22687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017040	T	6	6	22776	22781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017040	CTC	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_017040	CGC	2	6	23013	23018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017040	TAT	2	6	23019	23024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017040	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017040	GGA	2	6	23137	23142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017040	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_017040	TCC	2	6	23220	23225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_017040	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017040	GTT	2	6	23324	23329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017040	CGG	2	6	23377	23382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017040	TGT	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017040	GGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017040	GGT	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017040	AT	4	8	23593	23600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017040	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017040	AGA	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017040	T	7	7	23778	23784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017040	ATT	2	6	23826	23831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017040	ACT	2	6	23859	23864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_017040	TTCTT	2	10	23965	23974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_017040	AAT	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017040	CTTTT	4	20	24071	24090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017040	GTTA	2	8	24097	24104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017040	TAT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017040	TGA	2	6	24140	24145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017040	TAG	2	6	24328	24333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017040	TAA	2	6	24356	24361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017040	GAT	2	6	24401	24406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_017040	ATT	2	6	24497	24502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017040	CTA	2	6	24613	24618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_017040	A	7	7	24728	24734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017040	TAA	2	6	24757	24762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017040	A	6	6	24773	24778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017040	ATA	2	6	24821	24826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017040	ATA	2	6	24846	24851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017040	AGT	2	6	25187	25192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017040	T	7	7	25192	25198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017040	ATT	2	6	26390	26395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017040	A	6	6	58603	58608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017040	TATAT	2	10	79118	79127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017040	GGA	2	6	79130	79135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_017040	TCG	2	6	79253	79258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_017040	GTT	2	6	79317	79322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_017040	CGG	2	6	79440	79445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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455	NC_017040	TGG	2	6	80093	80098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_017040	ATG	2	6	80896	80901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017040	AAT	2	6	91563	91568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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